Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms