Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp11Q99K46 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp11Q99K46 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms