Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nlgn1Q99K10 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms