Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan1Q99J59 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms