Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn16Q925N4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms