Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Med28Q920D3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Med28Q920D3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms