Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Afg3l1Q920A7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Afg3l1Q920A7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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