Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csde1Q91W50 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms