Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms