Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajc28Q8VCE1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms