Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ApobrQ8VBT6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ApobrQ8VBT6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms