Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup58Q8R332 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Nup58Q8R332 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup58Q8R332 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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