Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf183Q8QZS5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms