Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MyripQ8K3I4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms