Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Cnppd1Q8K158 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnppd1Q8K158 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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