Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11fip3Q8CHD8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11fip3Q8CHD8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11fip3Q8CHD8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11fip3Q8CHD8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11fip3Q8CHD8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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Rab11fip3Q8CHD8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11fip3Q8CHD8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Rab11fip3Q8CHD8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Rab11fip3Q8CHD8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Rab11fip3Q8CHD8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Rab11fip3Q8CHD8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
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Rab11fip3Q8CHD8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Rab11fip3Q8CHD8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Rab11fip3Q8CHD8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Rab11fip3Q8CHD8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip3Q8CHD8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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