Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ercc8Q8CFD5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ercc8Q8CFD5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ercc8Q8CFD5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Ercc8Q8CFD5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ercc8Q8CFD5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ercc8Q8CFD5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ercc8Q8CFD5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ercc8Q8CFD5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ercc8Q8CFD5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ercc8Q8CFD5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ercc8Q8CFD5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ercc8Q8CFD5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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