Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cdkl1Q8CEQ0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkl1Q8CEQ0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms