Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Atg4aQ8C9S8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Atg4aQ8C9S8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Atg4aQ8C9S8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Atg4aQ8C9S8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Atg4aQ8C9S8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Atg4aQ8C9S8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Atg4aQ8C9S8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Atg4aQ8C9S8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Atg4aQ8C9S8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
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Atg4aQ8C9S8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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