Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg16l1Q8C0J2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Atg16l1Q8C0J2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Atg16l1Q8C0J2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Atg16l1Q8C0J2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Atg16l1Q8C0J2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg16l1Q8C0J2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Atg16l1Q8C0J2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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