Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccser1Q8C0C4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccser1Q8C0C4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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