Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms