Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TtpaQ8BWP5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms