Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp38Q8BW70 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Usp38Q8BW70 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Usp38Q8BW70 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Usp38Q8BW70 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Usp38Q8BW70 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Usp38Q8BW70 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Usp38Q8BW70 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Usp38Q8BW70 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Usp38Q8BW70 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Usp38Q8BW70 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp38Q8BW70 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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