Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp1Q8BJQ2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms