Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smarcal1Q8BJL0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms