Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Atg4dQ8BGV9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Atg4dQ8BGV9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Atg4dQ8BGV9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg4dQ8BGV9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Atg4dQ8BGV9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Atg4dQ8BGV9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Atg4dQ8BGV9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Atg4dQ8BGV9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg4dQ8BGV9 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms