Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms