Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Atg4bQ8BGE6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Atg4bQ8BGE6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Atg4bQ8BGE6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Atg4bQ8BGE6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Atg4bQ8BGE6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Atg4bQ8BGE6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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