Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cfap100Q80VN0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap100Q80VN0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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