Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpp38Q80UU2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms