Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lamp3Q7TST5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms