Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp17leQ7M764 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms