Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sox11Q7M6Y2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sox11Q7M6Y2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sox11Q7M6Y2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sox11Q7M6Y2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sox11Q7M6Y2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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