Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc6aQ78XR0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6aQ78XR0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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