Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
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Rph3alQ768S4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Rph3alQ768S4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Rph3alQ768S4 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Rph3alQ768S4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Rph3alQ768S4 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Rph3alQ768S4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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