Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nme8Q715T0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms