Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv1Q704Y3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms