Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SpopQ6ZWS8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SpopQ6ZWS8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms