Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf653Q6YND2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Znf653Q6YND2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms