Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms