Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl2Q6PA06 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms