Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc3bQ6NWW9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms