Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HelbQ6NVF4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms