Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Pdzrn3Q69ZS0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzrn3Q69ZS0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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