Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf280dQ68FE8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf280dQ68FE8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms