Protein–RNA interactions for Protein: Q67DU8

Clec4b2, Antigen presenting cell lectin-like receptor A1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b2Q67DU8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Clec4b2Q67DU8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms