Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ino80dQ66JY2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ino80dQ66JY2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ino80dQ66JY2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ino80dQ66JY2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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