Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trim24Q64127 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim24Q64127 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms