Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SypQ62277 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SypQ62277 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SypQ62277 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SypQ62277 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SypQ62277 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SypQ62277 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SypQ62277 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SypQ62277 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SypQ62277 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SypQ62277 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SypQ62277 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SypQ62277 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SypQ62277 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SypQ62277 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SypQ62277 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SypQ62277 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SypQ62277 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SypQ62277 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SypQ62277 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SypQ62277 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SypQ62277 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SypQ62277 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SypQ62277 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SypQ62277 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SypQ62277 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SypQ62277 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SypQ62277 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SypQ62277 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SypQ62277 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SypQ62277 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms